2016年10月10日，南京油運下發了《公司原油運輸經營管理體制調整總體方案》；15日—11月10日，涉及調整重點單位和部門，按總體方案制定的“整合資源，精干高效；對標市場，動態調整；清晰責任，責權統一”基本要求，構建原油事業部的平臺，明確事業部各部門職能，通過轉換機制，主輔分離，人員分流的形式，完成了事業部結構的設置、職能的分工、制度的建立、人員的選拔等工作。11月10日完成事業部所有人員的上崗和工作交接。11月10—30日，通過近20天的工作磨合，原油事業部試運行基本正常。12月1日，原油事業部正式運營。
李勝總經理在講話中說，原油事業部的組建，是公司積極適應長江原油運輸市場發展，努力提高服務質量和服務效率，提高公司運輸主業經營管理水平的一項重要舉措，對南京油運水運主業的發展具有十分積極和非常重要的意義。長江原油運輸具有運輸環節多、限制條件多、單位運輸成本高、運輸需求嚴重不均衡等特點，在長江原油運輸市場已經發生較大變化的情況下，如何提高質量、高效率組織好原油運輸，盡可能降低運輸成本是一項對南京油運來說十分具有挑戰的課題。
